1.特殊环境下的鸟类适应机制

特殊环境，如高海拔地区，常年低温、低氧、强紫外线辐射，对物种的生存形成极大的挑战。尽管如此，许多适应能力强的物种，在短期内能够适应高海拔的近端环境，并且在性状、遗传上发生了极大的变化。研究组整合比较基因组和转录组，结合表型变化，重点探讨环境压力，如低氧、强紫外环境对鸟类表型、基因型变化的影响机制。

2.鸟类的遗传多样性

山地环境、环境异质性与山脉的隔离机制，是遗传多样性形成的“摇篮与博物馆（museum and cradle）”。研究组结合比较基因组与种群遗传学，研究更新世以来，不同的地质事件对山地、岛屿鸟类基因组景观结构的影响。